Сырые данные по предоставляются в формате bcl2 или fastq.
В работу входит:
– оценка качества данных секвенирования
– удаление технических последовательностей из прочтений
– удаление контаминации из прочтений
– сборка транскриптома de novo (при необходимости)
– получение таблицы каунтов
– дополнительный анализ и интерпретация результатов (дифференциальная экспрессия, GO-enrichment)